圣母法衣存放教堂是一座有一个圆顶的小教堂,位于多棱宫右边。以前这里有一座莫斯科牧首约拿于1485年建成的圣母法衣存放教堂。据说,圣母法衣从巴勒斯坦送往君士坦丁堡,保护莫斯科免于被征服。例如,在俄罗斯-拜占庭战争中,牧首将圣母法衣扔进大海,引起的风暴摧毁了入侵的罗斯舰队。壁画表现拜占庭沙皇米海尔三世和牧首把圣母法衣扔进大海。教堂内保存有1627年的聖幛、1644年的壁画。这座教堂最初是莫斯科牧首的私人小教堂,但是在17世纪中叶归属俄国皇室。目前,这座教堂展出15世纪到19世纪的木质雕塑和圣像。